Facturation électronique : ce qui change réellement pour les kinésithérapeutes depuis septembre

Selon la mise au point publiée par Caducee.net, depuis le 1er septembre 2026, les médecins, infirmiers libéraux et masseurs-kinésithérapeutes sont concernés par la réforme, mais l’obligation immédiate porte surtout sur la réception des factures fournisseurs. Les feuilles de soins électroniques et le circuit SESAM-Vitale, eux, restent inchangés.

Ce qui change réellement pour un cabinet

Pour un cabinet de kinésithérapie dont l’activité repose principalement sur des soins exonérés de TVA, la réforme peut sembler paradoxale: vous pouvez ne pas avoir à émettre de factures électroniques pour vos soins, tout en devant être capable de recevoir celles envoyées par vos fournisseurs.

Concrètement, le cabinet doit être rattaché à une plateforme agréée pour recevoir les factures électroniques de ses prestataires et fournisseurs. Cette obligation concerne également les professionnels qui ne collectent pas la TVA lorsqu’ils exercent une activité économique indépendante entrant dans le champ de la réforme.

Il ne s’agit donc pas de modifier le fonctionnement habituel de vos feuilles de soins. La vigilance se situe plutôt du côté de l’adresse de réception, du choix de la plateforme et de la manière dont les factures seront consultées, classées et éventuellement transmises à votre comptabilité.

Un point mérite une attention particulière: le Portail public de facturation n’est pas présenté comme un guichet permettant de récupérer directement toutes les factures du cabinet. D’après les éléments rapportés, les échanges entre entreprises passent désormais par les plateformes agréées. Le professionnel peut y être rattaché directement, ou par l’intermédiaire d’un logiciel de gestion, d’un expert-comptable ou d’un autre prestataire compatible.

Les factures n’arriveront pas toutes au même rythme

La transition ne signifie pas que chaque fournisseur bascule simultanément vers la facture électronique. Les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire doivent émettre leurs factures au format électronique depuis le 1er septembre 2026. Les PME, TPE et microentreprises ne seront concernées par l’émission obligatoire qu’à partir du 1er septembre 2027.

Pendant cette période, un cabinet peut donc recevoir certaines factures par le nouveau circuit et d’autres selon les modalités antérieures. Cette coexistence demande surtout de la clarté dans l’organisation quotidienne: où les factures arrivent-elles, qui les vérifie, et comment éviter qu’un document soit oublié entre une messagerie, un logiciel de gestion et un dossier comptable?

Pour un professionnel déjà très sollicité par les soins, cette adaptation peut être vécue comme une charge supplémentaire. Pourtant, elle peut aussi devenir un espace d’harmonisation du cabinet, à condition de ne pas chercher à tout changer en même temps. L’objectif immédiat n’est pas de réinventer votre gestion, mais de sécuriser la réception des documents qui concernent votre activité.

Les vérifications utiles dès maintenant

Commencez par identifier les factures fournisseurs qui arrivent actuellement au cabinet: location, matériel, logiciels, téléphonie ou autres prestations liées à l’activité. Vérifiez ensuite avec votre expert-comptable ou votre prestataire de gestion quelle solution sera utilisée pour leur réception.

Trois questions peuvent vous aider à avancer sans vous disperser:

• le cabinet est-il rattaché à une plateforme agréée, directement ou par l’intermédiaire d’un logiciel compatible?
• quelle adresse ou quel compte sera utilisé pour recevoir les factures?
• qui, dans l’équipe, consultera régulièrement cette plateforme et transmettra les documents nécessaires à la comptabilité?

Pensez également à distinguer vos soins, vos éventuelles activités annexes et vos achats professionnels: les règles peuvent ne pas se présenter de la même façon selon la nature de l’activité et du fournisseur. En cas de doute, mieux vaut faire vérifier votre situation concrète plutôt que d’appliquer une règle générale à tout le cabinet.

Pour l’instant, le geste essentiel est donc simple: vous assurer que votre cabinet peut recevoir les factures électroniques par le bon intermédiaire, sans modifier inutilement le circuit des feuilles de soins. Une vérification calme de vos outils, de votre adresse de réception et de votre organisation comptable peut suffire à intégrer cette évolution avec davantage d’harmonie dans votre quotidien professionnel.